Навчання в ЗДМУ включає довузівський, вузівський і післядипломний етапи.
Довузівський етап: на підготовчих курсах з профільних дисциплін готуються для вступу до ЗДМУ абітурієнти, а також готуються для подальшого навчання у ВНЗ України іноземні студенти. З 2009 року при Університеті функціонує медичний коледж.
Вітчизняні та іноземні студенти в ЗДМУ мають можливість одержувати вищу освіту за спеціальностями:
Післядипломний етап включає навчання в:
В університеті станом на 1.09.2021 навчаються 8 124 студентів. Загалом контингент осіб, що навчаються у ЗДМУ (студентів, магістрів, інтернів, клінічних ординаторів, аспірантів, курсантів) налічує 11 497 осіб. В їх числі понад 3500 іноземних громадян з 42 країн світу.
Положення про організацію навчального процесу
Положення про переведення, відрахування, поновлення та надання академічної відпустки